Credo che la soluzione proposta da Carlino sia la migliore:
richiesta di un solo Cites cumulativo per N baby così in prima battuta sei già a posto, poi se e quando c'è bisogno di cederne alcune si scorpora l'esemplare con la richiesta di un Cites singolo.

Nel caso estremo da te prospettato, se una baby rimane senza nessun parente, male che vada dopo denuncia di nascita e chip la fonte F la si ottiene per movimentarla