Ciao, sembrerebbe in effetti un'infezione micotica o batterica del carapace, puoi seguire questa guida ai relativi paragrafi 1.5 e 1.6 (toccature con betadine soluzione cutanea al 10%):
Tartarugando - Le patologie delle tartarughe

quindi consultare un veterinario esperto in esotici per una visita (consentita anche in regime covid19):
Tartarugando - Lista veterinari esperti in rettili ed animali esotici

da valutare poi se vi siano dei fattori che hanno favorito l'insorgenza della cosa, es. filtragio dell'acqua, zona emersa ed esposizione solare o lampade specifiche ad alogenuri.