ti consiglio di postare qualche fotografia, per capire se realmente si tratta di un'infezione o se è altro, queste tartarughe non fanno la muta degli scuti come altre acquatiche, in cui lo strato superficiale dello scuto si stacca, ma gli scuti tendono a sfogliarsi progressivamente, pertanto durante la muta il carapace può avere un brutto aspetto senza che però vi sia nulla di patologico.
Immagino che la cosa non ti sia stata detta da un veterinario esperto in esotici, perché in quel caso il dr. ti avrebbe dato anche la terapia.
ciao