Da come scrivevi sembrava che il filtro era sul mobiletto, credo che allora i 50 cm siano tra il filtro e la base dell'acquario : considerando l'altezza dell'acqua nella vasca hai un dislivello di almeno 80 cm che è largamente sufficiente. Come ha suggerito gibo riempi tutto il filtro ed anche il tubo di uscita dall'acquario con l'acqua , tappa con un dito il tubo e immergilo di nuovo nell'acqua: a questo punto dovrebbe funzionare a meno di errori clamorosi ,tipo scambio dell'ingresso con l'uscita.