Da quello che hai scritto deduco che:
-L'alimentazione è errata
-Hai 2 lampade? Altrimenti non hai l'UVB o la spot.
- Se cambi completamente l'acqua allora il cloro irrita di sicuro gli occhi.
Questa frase scusa se te lo dico ma è inquietante:
Abbiamo sempre avuto coppie di tartarughe in casa, e non era mai successo loro nulla
Quante scusa?
Vivono in media 25 anni se tenute correttamente... mai pensato che forse c'è qualcosa che non va nell'allevamento?

Se riesci a fare delle foto, uploadarle su siti tipo Tinypic, imageshack o altri e a mettere i link è più facile che scrivere un trattato.